А это смотря какой Quartus II. Посмотрел 11 версию - FLEX там нету. Только MAX-II. А это я уже про 13 версию молчу и более свежие. Может, конечно, 7 или 9 версии и умеют, но я ими уже и не пользуюсь. С этими САПР, кстати, постоянно головняки. Не получается поставить лишь одну версию и ей пользоваться. Там каждый год что-то, да поменяется. Новые не поодерживают старое, старые не умеют новое, установленные на одном компьютере они зачастую могут конфликтовать в чём-то. Ну и так далее.