Ген + ген = цирковирус

[vak]

Поиграем в генетику как в кубики. Сколько нужно генов, чтобы вышло что-нибудь размножающееся?

Рекорд простоты известен в природе: всего из двух генов получается цирковирус. И там их целое семейство. Вот как выглядят цирковирусы BFDV и PCV2.



PCV2 заражает свиней, а BFDV птиц. Вирус состоит из кольцевой одноцепочечной ДНК, уложенной между несколькими экземплярами белка Cap.



Второй белок Rep занимается размножением вирусной ДНК в клетке хозяина. Он расщепляет кольцо ДНК цирковируса и даёт полимеразе хозяина начать репликацию. По окончании склеивает результат обратно в кольцо. Вот подробное объяснение от ИИ.



Подробности в статье: Replication of porcine circoviruses

Структуру белков Cap и Rep вируса PCV2 нетрудно добыть скриптом get_protein_sequence.py:

$ python3 get_protein_sequence.py O56129
Fetching protein sequence for UniProt accession: O56129
UniProt data retrieved for O56129: Capsid protein
Saved sequence to O56129.fasta

$ python3 get_protein_sequence.py Q8BB16
Fetching protein sequence for UniProt accession: Q8BB16
UniProt data retrieved for Q8BB16: Replication-associated protein
Saved sequence to Q8BB16.fasta

$ cat O56129.fasta
>O56129 | Capsid protein | UniProt Protein Sequence
MTYPRRRYRRRRHRPRSHLGQILRRRPWLVHPRHRYRWRRKNGIFNTRLSRTFGYTVKATTVRTPSWAVDMMRFNIDDFVPPGGGTNKISIPFEYYRIRKVKVEFWPCSPITQGDRGVGSTAVILDDNFVTKATALTYDPYVNYSSRHTIPQPFSYHSRYFTPKPVLDSTIDYFQPNNKRTQLWLRLQTSRNVDHVGLGTAFENSIYDQDYNIRVTMYVQFREFNLKDPPLKP

$ cat Q8BB16.fasta
>Q8BB16 | Replication-associated protein | UniProt Protein Sequence
MPSKKNGRSGPQPHKRWVFTLNNPSEDERKKIREPPISLFDYFIVGEEGNEEGRTPHLQGFANFVKKQTFNKVKWYLGARCHIEKAKGTDQQNKEYCSKEGNLLIECGAPRSQGQRSDLSTAVSTLLESGSLVTVAEQHPVTFVRNFRGLAELLKVSGKMQKRDWKTNVHVIVGPPGCGKSKWAANFADPETTYWKPPRNKWWDGYHGEEVVVIDDFYGWLPWDDLLRLCDRYPLTVETKGGTVPFLARSILITSNQTPLEWYSSTAVPAVEALYRRITSLVFWKNATEQSTEEGGQFVTLSPPCPEFPYEINY

Comments

[juan_gandhi]

Охренеть. Кольцевая днк. И ты работаешь с файлами формата fasta. Всё это как-то удивляет.

[vitr]

А также в Уголовном кодексе – приравнять бандеровский символ к символам, которые соответствуют немецкому национал-социализму, общеизвестному как нацизм, советскому коммунизму, и внести изменения в закон об Институте национальной памяти – Комиссии по преследованию преступлений против польского народа в части, касающейся преступлений ОУН-УПА.

[vak]

Прожить жизнь надо так, чтобы твоё имя и через сто лет вызывало дрожь в коленках у рашистов.
(Степан Бандера, неопубликованное)

А с поляками украинцы помирятся, не вопрос.

[vak]

В наши школьные годы ничего этого не было известно. В 21 веке живём, однако.

[vitr]

Рашисты - это поляки?

Нацисты, типа тебя, всё таки полные дегенераты.

[vak]

Таки говно полезло наружу.