![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
(репост)
А помните, в 2010 году была создана первая синтетическая бактерия с минималистичным геномом — Mycoplasma laboratorium JCVI-syn1.0? Оказывается с тех пор было несколько обновлений, при которых геном всё уменьшали, а бактерия оставалась способной жить и размножаться. Нынешняя версия — JCVI-syn3A, в её геноме всего 493 гена, 543 тысячи спаренных оснований, то бишь примерно 130 килобайт информации. Полностью известен точный молекулярный состав и структурное устройство этих бактерий во все фазы их стандартного жизненного цикла. Почти про все макромолекулы известны их трёхмерные структуры, про большую часть — ещё и функциональные свойства. В частности, про 401 ген из 493 известна их функция: http://synwiki.uni-goettingen.de/
Так вот, я пропустил важную новость — в январе 2022 года была создана работающая компьютерная модель всей клетки JCVI-syn3A!
https://github.com/Luthey-Schulten-Lab/Minimal_Cell
И она очень точно соответствует экспериментальным наблюдениям. То есть теперь можно утверждать, что поняты ещё и все процессы (физические и биохимические) происходящие внутри бактерии во всех фазах её стандартного жизненного цикла.
На подходе версия JCVI-syn4, где количество генов в геноме будет ещё немного уменьшено (примерно до 400 штук), и про все имеющиеся гены будет известна из функциональность.
А помните, в 2010 году была создана первая синтетическая бактерия с минималистичным геномом — Mycoplasma laboratorium JCVI-syn1.0? Оказывается с тех пор было несколько обновлений, при которых геном всё уменьшали, а бактерия оставалась способной жить и размножаться. Нынешняя версия — JCVI-syn3A, в её геноме всего 493 гена, 543 тысячи спаренных оснований, то бишь примерно 130 килобайт информации. Полностью известен точный молекулярный состав и структурное устройство этих бактерий во все фазы их стандартного жизненного цикла. Почти про все макромолекулы известны их трёхмерные структуры, про большую часть — ещё и функциональные свойства. В частности, про 401 ген из 493 известна их функция: http://synwiki.uni-goettingen.de/
Так вот, я пропустил важную новость — в январе 2022 года была создана работающая компьютерная модель всей клетки JCVI-syn3A!
https://github.com/Luthey-Schulten-Lab/Minimal_Cell
И она очень точно соответствует экспериментальным наблюдениям. То есть теперь можно утверждать, что поняты ещё и все процессы (физические и биохимические) происходящие внутри бактерии во всех фазах её стандартного жизненного цикла.
На подходе версия JCVI-syn4, где количество генов в геноме будет ещё немного уменьшено (примерно до 400 штук), и про все имеющиеся гены будет известна из функциональность.
