Происхождение жизни

[vak]

Оригинал взят у _hellmaus_ в Происхождение жизни

Ахтунг! Для понимания многих мест желательно знать химию.

1. ХИМИЧЕСКИЕ ЭЛЕМЕНТЫ, ДОСТУПНЫЕ ДЛЯ ПОСТРОЕНИЯ ЖИВЫХ ОРГАНИЗМОВ

2. ИСТОРИЯ ПРЕДСТАВЛЕНИЙ О ПРОИСХОЖДЕНИИ ЖИЗНИ

3. СОВРЕМЕННАЯ ПРЕДБИОЛОГИЧЕСКАЯ ХИМИЯ И ПРОБЛЕМА ХИРАЛЬНОЙ ЧИСТОТЫ

4. ФОТОХИМИЯ, ПРОИСХОЖДЕНИЕ НУКЛЕОТИДОВ И РНК

5. ВОССТАНОВЛЕНИЕ СО2 И ЭНЕРГЕТИЧЕСКОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ ПРЕДБИОГЕННЫХ СИНТЕЗОВ. «ЖЕЛЕЗНЫЙ МИР» И «ЦИНКОВЫЙ МИР».

6. ПРОИСХОЖДЕНИЕ БЕЛКОВОГО СИНТЕЗА И ГЕНЕТИЧЕСКОГО КОДА

7. МИР ВИРУСОВ, ПОСЛЕДНИЙ ВСЕОБЩИЙ ПРЕДОК И ПРОИСХОЖДЕНИЕ ДНК

8. ПРОИСХОЖДЕНИЕ МЕМБРАН И МЕМБРАННОЙ ЭНЕРГЕТИКИ

9. ЗАКАТ «ЦИНКОВОГО МИРА», ПРОКАРИОТНАЯ БИОСФЕРА И ПРОИСХОЖДЕНИЕ ФОТОСИНТЕЗА

10.1 ПРОИСХОЖДЕНИЕ ЭУКАРИОТ
10.2 ВИРУСНОЕ ПРОИСХОЖДЕНИЕ ЯДРА

Исходные статьи  выложены!

Синим цветом выделены куски текста, добавленные в 2012 году.

Comments

[kondybas.livejournal.com]

Вау! Отлично написано, вдобавок.

[beaver-cherokee.livejournal.com]

но ключевая тема с сульфидом цинка (учитывая весь комплекс условий тогдашней Земли) всё-таки кажется здорово притянутой за уши.

[golosptic.livejournal.com]

Почему?

[realurix.livejournal.com]

Главный вопрос - почему геном кодируется именно триплетами? - так и не раскрыт. К идее триплетов я пришёл в 80-х совсем иным путём, поскольку не химик и не биохимик, а всего лишь программист, а значит знаю свойства информации.
Но в целом подборка неплохая.

[http://users.livejournal.com/_hellmaus_/]

С какой стороны вы пришли к идее триплетов? У биологов все просто - аминокислот в белках 20, значит 16 дублетов для их кодирования мало, а 64 триплетов хватит с избытком. Вот вопрос, почему используются именно эти 20 аминокислот - сложнее.

[realurix.livejournal.com]

Три - это наиболее близкое основание к числу e=2.71..., которое если использовать в качестве основания позиционной системы счисления даёт наименьшее число символов, необходимых для кодирования числа. Это число Эйлера. Это же основание даёт наибольшее кодовое расстояние между числами для случая кодирования с защитой от ошибки. И не только отображения кода, но ещё позволяет хранить направления чтения "бита" в кодовой последовательности. Для кодирования генома используется всего 4 аминокислоты из 20. Биологи так и не объяснили каким образом "перфолента" РНК двигается через рибосому. А если предположить, что существует всего один триплет, дополняющий данный, который создаёт такое распределение потенциалов (энергетика), что они сами проталкивают "перфоленту" РНК через рибосому, то сразу появляется объяснение движущей силы синтеза. Рибосома - это очень простая конструкция, слишком простой автомат, слишком простая для того, чтобы "знать" куда надо двигать РНК. Кстати, триплеты обратного движения могут служить маркерами начала и конца генов.

Если внимательно посчитать необходимое число кодов для работы рибосомы, то остаётся как раз триплет.